Modern Problems of Science and Educationrae.ru
Scientific journal

Modern Problems of Science and Education

ISSN 2070-7428VAK ListRSCI IF = 0,936

OBTAINING RECOMBINANT HUMAN APOLIPOPROTEIN A-I AND STUDY ITS INTERACTION WITH LIGANDS OF DIFFERENT BIOCHEMICAL NATURE

Ryabchenko A.V.1,Kotova M.V.1,Polyakov L.M.1
1Federal State Budgetary Scientific Institution «Research Institute of Biochemistry»

Современная фармакология предлагает широкий спектр цитостатиков для химиотерапии опухолей различной природы и локализации (рубомицин, актиномицин Д, циклофосфан, винбластин и др.) [3]. Однако эти препараты не обладают высокой избирательностью действия и, как следствие, оказывают токсический эффект как по отношению к опухолевым, так и здоровым клеткам. Такая химиотерапия приводит к тяжелым осложнениям, связанным с развитием функциональной недостаточности большинства органов и систем. В связи с этим возникает необходимость в использовании веществ-транспортеров цитостатиков, которые бы селективно доставляли лекарственные препараты в опухолевые клетки. В Институте биохимии на примере винбластина и актиномицина Д было показано, что человеческий аполипопротеин А-I (апоА-I) способен связывать цитостатики и доставлять их в клетки [1, 2]. Изучение применения апоА-I для подавления опухолевого роста в лабораторных условиях показал, что при использовании апоА-I для транспорта цитостатиков можно подобрать такие концентрации цитостатиков, при которых подавляется рост опухолевых клеток, при этом токсическое действие на окружающие ткани резко снижается [1]. В связи с этим апоА-I представляет интерес для изучения его транспортной функции в качестве средства доставки цитостатиков и других биологически активных веществ в клетки. Классические методы получения апоА-I в качестве источника белка используют сыворотку крови человека [5, 6], однако по этическим причинам этот ресурс не может быть широко использован. Это обстоятельство сдерживает применение апоА-I в широкой практике. С развитием технологии рекомбинантных ДНК появилась возможность получать человеческие белки в различных организмах, например, в бактериях в достаточно больших количествах и сравнительно менее трудоемкими способами. Однако известно, что рекомбинантные белки могут отличаться по биохимическим свойствам от своих природных аналогов. Таким образом, целью нашего исследования являлось получение рекомбинантного апоА-I человека в клетках E.coli и исследование его способности связывать лиганды различной биохимической природы в сравнении с нативной формой белка.

Материалы и методы

Выделение и очистка апоА-I. Для получения рекомбинантного апоА-I использовали продуцент на основе E.coli шт. BL21(DE3), полученный ранее в нашей лаборатории [7]. Белок выделяли из клеток E.coli в денатурирующих условиях (6М мочевина) путем разрушения клеток ультразвуком с последующим выделением белка из клеточного лизата аффинной хроматографией на сорбенте Ni-NTA сефарозе («Qiagen», США) согласно работе [8]. Выделение и очистку нативного апоА-I из плазмы крови человека проводили по методике, описанной в работе [5]. Сначала методом изоплотностного центрифугирования в растворе бромида калия выделяли фракцию липопротеинов высокой плотности (ЛПВП), затем в денатурирующих условиях из фракции ЛПВП выделяли апоА-I методом гель-фильтрации на Сефарозе 6B-CL («Pharmacia», Швеция). На заключительных этапах белки переводили в физиологичные условия путем диализа против стандартного фосфатно-солевого буфера с рН 7,4. Качественный анализ белков проводили в 12 % полиакриламидном геле по Лэммли. Готовые белки хранили при 4 0С.

Измерение концентрации белков. Измерение концентрации белков проводили спектрофотометрически в ЦКП «Спектрометрические измерения» на базе НИИ биохимии, г. Новосибирск (спектрофотометр Evolution 300 («Thermo Scientific», США). При λ=280 нм 1 о.е./мл принимали за концентрацию белка 1 мг/мл.

Исследуемые лиганды. Актиномицин Д («AppliChem», Германия), доксорубицин («AppliChem», Германия), олигомицин («Sigma-Aldrich», США), ампициллин – бензилпенициллина натриевая соль (ОАО «Синтез», Россия) и эстриол («Sigma-Aldrich», США).

Определение констант связывания. Константы связывания лигандов с белками рассчитывали методом тушения триптофановой флуоресценции [5]. Измерения проводили в термостатируемой кювете при 37º С в фосфатно-солевом буфере на спектрофлюориметре RF-530 («Shimadzu», Япония) при длине волны возбуждения 285 нм и эмиссии в диапазоне от 300 до 400 нм. Титрование проводили добавлением аликвот по 20 мкл стоковых растворов лигандов с концентрацией 1 мг/мл к 2 мл раствора апоА-I с концентрацией 100 мкг/мл. После добавления цитостатиков к белкам образцы инкубировали не менее 3 мин, после чего проводили замеры. Каждая проба лиганда исследовалась не менее трех раз. Расчет константы связывания осуществляли по методу Аттала и Лата [10].

Статистическая обработка результатов производилась с помощью программы «StatPlus 2009 Professional». Данные представлены как среднее значение величины ± ошибка средней величины, n – количество опытов.

Результаты исследования и их обсуждение

В результате выделения белка из клеток-продуцентов был получен полипептид с молекулярной массой ~ 33,4 кДа. Полученный полипептид представлял из себя слитый белок апоА-I человека с синтетической лидерной последовательностью из 43 аминокислотных остатков (а.о.) на N-конце белка. Выход химерного рекомбинантного апоА-I составил 182±23 мг из одного литра культуры клеток (n=14), что значительно превышает почти на 80 % результаты, представленные в работе [13], в которой использовался оптимизированный ген для экспрессии в клетках E.coli и аналогичная экспрессирующая система (клетки E.coli шт. BL21(DE3) и ген апоА-I под контролем промотора гена 10 бактериофага Т7). Вариант этой химерной формы белка (апоА-I.Х) использовался для изучения способности связывать исследуемые лиганды. Кроме того, данный химер использовался для последующего превращения в белок зрелой формы. Синтетическая лидерная последовательность содержала лабильный фрагмент Asp-Pro, что позволяло отщеплять лидерную последовательность от основного белка апоА-I с помощью кислотного гидролиза. Кислотный гидролиз и последующее очищение белка проводили согласно процедуре, описанной в работе [8]. Полученный белок без лидерной последовательности (апоА-I.З) имел молекулярную массу порядка 28 кДа и не имел двух а.о. с N-конца (аспарагиновая и глутаминовая кислоты), в остальном по первичной структуре он был идентичен белку зрелой формы апоА-I человека (апоА-I.Н). Выход очищенного белка апоА-I.З составлял 61 мг из одного литра культуры клеток (n=5) или 34 мг из 100 мг исходного химерного рекомбинантного апоА-I.Х.

Ранее сотрудниками Института биохимии методом тушения флуоресценции триптофана было показано взаимодействие нативного апоА-I человека с тетрагидрокортизолом [4], а также с цитостатиками – винбластином и актиномицином Д [1, 2]. Поэтому мы предположили, что данный метод может быть использован для подтверждения функциональных свойств полученных нами рекомбинантных форм апоА-I (с лидером и без) в сравнении с нативной формой белка, а в качестве лигандов могут быть использованы антибиотики, в том числе антибиотики противоопухолевого действия, включая уже описанный актиномицин Д [2], а также гормон стероидной природы – эстриол [9]. В результате для исследования были выбраны актиномицин Д, доксорубицин, олигомицин, ампициллин и эстриол.

Изучение связывания проводили методом тушения триптофановой флуоресценции [5]. Метод основан на взаимодействии белка с лигандом, в результате такого взаимодействия происходит экранирование триптофаниловых остатков белка и уменьшение флуоресценции (тушение) в зависимости от количества связанного лиганда. Типичный пример снижения флуоресценции при образовании комплексов представлен на рисунке. На рисунке кривая с максимальным пиком (кривая 1) соответствует флуоресценции чистого белка (принимается за 100 %), далее идет снижение флуоресценции по мере увеличения количества связанного лиганда в растворе белка (кривые 2). Кривая с минимальным значением флуоресценции соответствует максимальной концентрации олигомицина в растворе без белка (кривая 3).

Спектры тушения триптофановой флуоресценции рекомбинантного апоА-I.З при взаимодействии с олигомицином. По оси абсцисс представлена длина волны эмиссии, по оси ординат – относительные единицы флуоресценции

В исследовании использовали три формы белка: апоА-I.Х – рекомбинантный полипептид апоА-I с лидерной последовательностью из 43 чужеродных а.о.; апоА-I.З – зрелая форма белка апоА-I человека, полученная из предшественника апоА-I.Х путем кислотного гидролиза; апоА-I.Н – человеческий белок апоА-I зрелой формы (нативная форма), выделенный из плазмы крови.

На основании кривых тушения флуоресценции были рассчитаны константы связывания полученных форм белка апоА-I человека с лигандами (таблица).

Константы связывания полученных форм белка апоА-I с лигандами (1 х 105 М-1)

Белок

Лиганды

Актиномицин Д

Доксорубицин

Олигомицин

Ампициллин

Эстриол

АпоА-I.Х

1,1±0,4

4,8±0,4

9,8±0,8

0,5±0,1

2,5±0,3

АпоА-I.З

1,9±0,4

5,0±0,6

11,0±1,1

0,5±0,1

2,4±0,2

АпоА-I.Н

1,7±0,3

3,8±0,8

10,3±0,9

0,6±0,2

1,9±0,3

Следует отметить, что полученная нами константа связывания для актиномицина Д 1,7±0,3 х 105 М-1 совпадает с ранее опубликованными данными для нативного человеческого апоА-I, 1,4 х 105 М-1 [2], так же как и в случае с эстриолом 1,9±0,3 х 105 М-1 в настоящем эксперименте и 2,1 х 105 М-1 в работе [9]. Эти результаты свидетельствуют о корректности постановки метода исследования. В целом, полученные результаты показывают, что величины констант связывания перечисленных лигандов с различными исследуемыми формами белка апоА-I лежат в пределах 0,5 -11,0 х 105 М-1, что указывает на определенную специфичность взаимодействия апоА-I с данными лигандами.

Из таблицы видно, что полученные значения констант связывания для каждого лиганда при взаимодействии с тремя различными формами апоА-I не имели достоверных отличий. Это подтверждает функциональное сходство полученного рекомбинантного апоА-I из клеток E.coli с нативным апоА-I из плазмы крови человека и дает нам основание предполагать, что полученный рекомбинантный белок может быть использован в качестве переносчика в клетку обладающих противоопухолевым действием актиномицина Д, доксорубицина и олигомицина.

Близкие значения констант связывания апоА-I.Х с другими формами белков позволяют сделать предположение о том, что «хвост» в виде лидерной последовательности из 43 а.о. на N-конце апоА-I не мешал взаимодействию белка с лигандами. Вероятно, это обусловлено тем, что N-конец белка не вовлечен в эти взаимодействия. Это предположение согласуется с литературными данными, в которых предполагается, что N-концевая область (1-43 а.о.) имеет умеренное связывание с фосфолипидами и является необходимой для стабилизации свободной от липидов структуры апоА-I [12, 14]. Центральный же домен белка апоА-I (100-186 а.о.) отвечает за активацию лецитин-холестерин ацилтрансферазы, участвует в регуляции взаимодействия с фосфолипидами и отвечает за пластичность молекулы [11]. C-концевой участок (185-243 а.о.) в основном не имеет определенной структуры и отвечает за инициирование связывания с липидами, агрегацию, в обратном транспорте холестерина, а также имеет самый высокий аффинитет к фосфолипидам [14].

Таким образом, полученные нами результаты подтверждают предположение о том, что N-концевой участок апоА-I не участвует в активном взаимодействии с биохимическими лигандами. Данное понимание структуры белка может быть использовано при конструировании химерных полипептидов на основе апоА-I с целью сохранения его функциональной активности в качестве переносчика различных биологически активных веществ в клетку.

Выводы

На примере пяти лигандов различной биохимической природы показа способность рекомбинантного и нативного апоА-I образовывать комплексы с данными веществами, константа связывания таких комплексов лежит в пределах 0,5-11,0 х 105 М-1. Близкие значения констант связывания нативного и рекомбинантного апоА-I с лигандами подтверждает схожесть биологических свойств двух полученных форм рекомбинантного апоА-I с нативным апоА-I-белком плазмы крови человека. На примере актиномицина Д, доксорубицина и олигомицина показана способность полученного рекомбинантного апоА-I образовывать комплексы с противоопухолевыми препаратами, что позволяет рассматривать рекомбинантный апоА-I в качестве перспективного носителя этих лекарственных средств.


Bibliographic Reference

Ryabchenko A.V., Kotova M.V., Polyakov L.M. OBTAINING RECOMBINANT HUMAN APOLIPOPROTEIN A-I AND STUDY ITS INTERACTION WITH LIGANDS OF DIFFERENT BIOCHEMICAL NATURE // Modern Problems of Science and Education. 2016. No. 5.;
URL: https://www.science-education.ru/en/article/view?id=25448 (accessed: 12/10/2026).